David Sankoff

Carte électronique

David Sankoff
Professeur titulaire, Chaire de Recherche du Canada

B.Sc.
M.Sc.
Ph.D. (McGill)

KED 303B

Bureau : 613-562-5800 poste 3525

Courriel professionnel : sankoff@uOttawa.ca

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Biographie

Élaboration de modèles, d’algorithmes et de procédures d’induction statistique pour procéder à l’analyse comparative de différents génomes. Professeur Sankoff utilise les approches mathématiques pour étudier les gènes et les génomes. Les projets qu’il entreprend visent à étendre ce domaine sur plusieurs fronts, incluant la modélisation probalistique de l’évolution des bactéries, des protistes et des organismes supérieurs; et les conséquences de différents mécanismes, tels que la translocation et l’inversion chromosomiques et la duplication génique et génomique, sur l’évolution de l’ordre génique.

Publications sélectionnées :

  • Casesnoves Ferrer, R., D. Sankoff, and M.T. Turell. Linguistic shift and community language: the effect of demographic factors in the Valencian Region, Balearic Islands and Catalonia. Globalization and Language in the Spanish-speaking World (C. Mar-Molinero & M. Stewart, eds.) Palgrave Macmillan, 197-219, 2006
  • Zheng, C. Q. Zhu, and D. Sankoff. Removing noise and ambiguities from comparative maps in rearrangement analysis. Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2007
  • Xu, W., C. Zheng, and D. Sankoff. Paths and cycles in breakpoint graphs of random multichromosomal genomes. Journal of Computational Biology 14, 2007
  • Adam, Z., M. Turmel, C. Lemieux, and D. Sankoff. Common intervals and symmetric difference in a model-free phylogenomics, with an application to streptophyte evolution. Journal of Computational Biology 14, 2007
  • Sankoff, D. and C. Zheng Q. Zhu. Polyploids, Genome Halving and Phylogeny. Bioinformatics, 2007

Étudiants et chercheurs postdoctoraux supervisés :

  • Étudiants aux 2e et 3e cycles :
    • Jamshidpey, Arash (co-supervisé avec Donald Dawson)
    • Larlee, Caroline Anne
    • Meghdari Miardan, Mona
    • Yu, Zhe
    • Zhang, Yue
  • Chercheurs Postdoctoraux:
    • Zheng, Chunfang

Groupe(s) de recherche : Statistique et probabilité

Champs d'intérêt

  • Génomique mathématique
  • Algorithmes
  • Probabilités appliquées
  • Biologie informatique
  • Bioinformatique
  • Sociolinguistique
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